天才将棋少年桐山零，在独自生活中，与川本三姐妹相遇，逐渐敞开心扉。
传说中的“奇迹世代”第六人黑子哲也，与搭档火神大我一起，挑战曾经的队友。
高中生侦探工藤新一被黑衣组织灌下毒药变小，化名柯南，一边追查组织，一边解决无数棘手案件。